醫院藥學部集藥品供應保障、藥學技術服務、科研教學為一體，是湖南省個體化藥物治療咨詢指導中心懷化分中心，懷化市臨床用藥質量控制中心、懷化市醫學會臨床藥學專業委員會掛靠單位，臨床藥學學科是市級重點?？?。已基本形成了四個方向：1、治療藥物監測和個體化用藥；2、藥物臨床試驗和上市后藥品臨床評價方法研究；3、針對心腦血管疾病、糖尿病等慢病患者、神經系統疾病及特殊人群的藥學服務；4、民族醫藥開發。

藥學部設有發熱藥房、門急診藥房、住院藥房、中藥房、藥品庫房、臨床藥學室和Ⅰ期臨床研究室等部門?，F有藥學專業技術人員29人，其中主任藥師1人，副主任藥師6人，主管藥師13人；碩士7人，具有本科及以上學歷人員占62.1 %。

科室堅持“以患者為中心”的理念，保障藥品供應，開展藥學服務，促進臨床安全合理用藥。呼吸科、心內科、內分泌科和血液腫瘤科科等臨床專業配備有?？婆R床藥師，開展藥學查房、藥學監護、藥師會診、患者用藥教育和咨詢等服務；治療藥物監測現開展15個品種，有助于患者個體化給藥方案制訂和藥物相互作用的研究，為患者安全合理用藥保駕護航，也促進臨床藥學與臨床醫學全面、科學、協同發展。

科室近年來發表論文15篇，其中SCI收錄5篇；獲懷化市科技進步成果二、三等獎4項；主編、副主編著作5部；近年來成功申報湖南省自然科學基金項目2項、湖南省教育廳課題項目3項，湖南省中醫藥管理局重點項目、湖南省衛健委、湖南省科技廳項目各1項，湖南醫藥學院2項，懷化市科技局1項，白求恩基金會橫向課題2項。榮獲“中國藥學會2017年信息網工作先進單位”、“湖南省臨床用藥質量控制中心2018年度優秀市州臨床用藥質控中心”、“湖南省醫院協會藥事管理專業委員會2020年度巡講優秀單位”以及多次被評為“懷化市優秀質量控制中心”、“懷化市藥品不良反應/事件監測工作先進單位”等集體榮譽與獎勵。

藥學部作為湖南醫藥學院臨床藥學教研室主任單位，承擔、《藥學服務概論》、《臨床藥理學》等課程的教學以及繼續教育、進修培訓、實習帶教工作。作為“懷化市臨床用藥質量控制中心”掛靠單位，為全市臨床用藥質量控制和合理用藥水平的提高起到了重要的作用。